Es recomana emmagatzemar les caixes de paper d'envasat d'aliments de manera semi-segellada; això protegeix contra la pols i els insectes alhora que permet una lleugera ventilació, evitant així l'acumulació d'humitat i la humitat causada per la total estanquitat. Les caixes es poden col·locar en contenidors d'emmagatzematge amb tapa o-bosses a prova de pols-deixant un petit espai per al flux d'aire-i mantenir-los en prestatges secs i frescos, allunyats de fogons, piques i finestres. Tot i que l'emmagatzematge completament hermètic evita la pols, la manca de circulació de l'aire al llarg del temps pot provocar condensacions a causa de les fluctuacions de temperatura, fent que les caixes es tornin humides i toves; al contrari, deixar-los completament oberts els exposa a la pols i el greix, comprometent la higiene dels aliments. L'emmagatzematge semi-segellat manté les caixes netes i seques alhora que preserva la integritat estructural del paper; quan s'emmagatzema correctament, la qualitat es manté estable durant 6-12 mesos sense requerir condicions d'emmagatzematge complexes, cosa que la converteix en una solució pràctica per a diversos establiments de serveis d'alimentació.